मौखिक बाधा को तोड़ना（4）

चक्रीय पेप्टाइड पीटीजी-200 की खोज और व्युत्पन्नीकरण
पीटीजी-200 की खोज

2016 में, प्रोटेगॉनिस्ट ने IL{7}}23R को लक्षित करने वाले एक मौखिक पॉलीपेप्टाइड अवरोधक के लिए एक पेटेंट (WO2016011208) का खुलासा किया, जिसमें IL-23R से जुड़ने में सक्षम कई रैखिक और चक्रीय पेप्टाइड अनुक्रम शामिल थे। विशेष रूप से, इस पेटेंट की तालिका 3ए में प्रस्तुत अनुक्रम, फेज डिस्प्ले के माध्यम से एमडीएल द्वारा पहले प्राप्त संरचनाओं से काफी मिलते-जुलते हैं। सूचीबद्ध रैखिक पेप्टाइड अनुक्रमों में मुख्य रूप से मूल संरचना -WQDYW- शामिल है (जैसा कि नीचे दिए गए चित्र में दिखाया गया है)। उनमें से, सबसे शक्तिशाली अणु (SEQ ID NO.4) ने 4.1 µM की IL-23R निरोधात्मक सांद्रता हासिल की, इसकी संरचना MDL के पेप्टाइड 23.15 के एन-टर्मिनस को एसिटाइलेट करके बनाई गई है।
उल्लेखनीय है कि एमडीएल और प्रोटागोनिस्ट ने एक बार 2014 में आईएल -23आर पेप्टाइड पर सहयोग पर बातचीत की थी, जिसके दौरान एमडीएल ने अपनी शोध जानकारी साझा की थी। 2015 में, दोनों पक्षों ने एक गोपनीयता समझौते पर हस्ताक्षर किए, लेकिन वार्ता उसी वर्ष अक्टूबर में समाप्त हो गई। बाद के कानूनी दस्तावेजों से पता चला कि एमडीएल ने अमेरिकी जिला न्यायालय में नायक के खिलाफ मुकदमा दायर किया, जिसमें पीटीजी-200 द्वारा पेटेंट उल्लंघन का आरोप लगाया गया, जिसमें पेटेंट यूएस 8946150 (एमडीएल) और यूएस 9624268 (नायक) शामिल थे। 2018 में, एमडीएल के पेटेंट उल्लंघन के दावे को खारिज कर दिया गया क्योंकि प्रोटागोनिस्ट ने इन पेप्टाइड्स का उपयोग ऑटोइम्यून बीमारियों के लिए एफडीए-अनुमोदित दवाओं को विकसित करने के लिए किया था, जो सुरक्षित बंदरगाह नियम के तहत संरक्षित थी।

इस लेख के फोकस पर लौटते हुए, प्रोटेगॉनिस्ट ने बाद के आणविक संशोधनों में एमडीएल द्वारा प्रस्तावित - WQDYW कोर संरचना को बरकरार रखा, लेकिन चक्रीकरण रणनीति में विभिन्न डिजाइनों को अपनाया। उन्होंने एक संरक्षित संरचना बनाने के लिए मुख्य अनुक्रम में एक Cys को शामिल किया {{2} CXX -WQCYW - (जैसे कि - CQTWQCYW -), और इस संरचना के चारों ओर सैकड़ों पेप्टाइड्स प्राप्त किए, जिससे गतिविधि नैनोमोलर स्तर तक बढ़ गई (जैसा कि नीचे दिए गए चित्र में दिखाया गया है)। इसके अलावा, प्रोटागोनिस्ट ने विभिन्न चक्रीकरण विधियों का भी प्रयास किया है, जिसमें दो सीआईएस साइटों के बीच एक थायोथर बंधन शुरू करना, ओलेफिन मेटाथिसिस प्रतिक्रिया (आरसीएम) का उपयोग करना और एमाइड बांड चक्रीकरण रणनीतियों को लागू करना शामिल है। हालाँकि, प्रयोगात्मक परिणामों से संकेत मिलता है कि डाइसल्फ़ाइड या थायोथर बांड द्वारा चक्रीय पेप्टाइड्स आमतौर पर आरसीएम या एमाइड बांड द्वारा चक्रीय पेप्टाइड्स की तुलना में बेहतर गतिविधि प्रदर्शित करते हैं।

पीटीजी -200 (यौगिक सी) के पीके डेटा का खुलासा पेटेंट में किया गया है: 20 मिलीग्राम/किग्रा की खुराक पर चूहों को मौखिक प्रशासन के बाद, यौगिक मुख्य रूप से गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल ऊतक में वितरित किया जाता है, बेहद कम प्रणालीगत जोखिम के साथ। उनमें से, छोटी आंत के म्यूकोसा का AUC 355 μg · h/g है, और कोलन म्यूकोसा का AUC 77 μg · h/g है। हालाँकि, प्लाज्मा में AUC केवल 0.3 μg · h/mL है, मल में रिकवरी दर 40% है। यह यौगिक विभिन्न गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल तरल पदार्थ और कम करने वाले वातावरण में अच्छी स्थिरता प्रदर्शित करता है: इसका आधा जीवन सिम्युलेटेड आंत्र तरल पदार्थ (एसआईएफ), सिम्युलेटेड गैस्ट्रिक तरल पदार्थ (एसजीएफ), और मानव आंत्र तरल पदार्थ में 24 घंटे से अधिक है, और कम करने वाले एजेंट डीटीटी में इसका आधा जीवन 2 घंटे से अधिक है। एसपीआर प्रयोग के परिणामों से पता चला कि यह अकेले IL-12R 1 से नहीं जुड़ता है, बल्कि IL-23R और IL-12R 1/IL-23R सह व्यक्त की सतह से क्रमशः 2.42 nM और 2.56 nM की मजबूत आत्मीयता और KD मान के साथ बंध सकता है।

पीटीजी-200 का व्युत्पन्न

2017 में, प्रोटेगॉनिस्ट ने IL-23R पेप्टाइड इनहिबिटर (WO2017011820) के लिए अपना दूसरा पेटेंट प्रकाशित किया। यह पेटेंट पहले पेटेंट के ढांचे को 227 व्युत्पन्न अनुक्रमों (SEQ ID NO.1030-1256) द्वारा विस्तारित करता है और चक्रीय पेप्टाइड पर संरचनात्मक इकाइयों का परिचय देता है जो विवो में आधे जीवन को बढ़ा सकते हैं (जैसा कि निम्नलिखित आंकड़े में दिखाया गया है)। फार्माकोकाइनेटिक अध्ययनों से पता चला है कि चूहों को 10 मिलीग्राम/किग्रा पेप्टाइड नंबर 1185 के मौखिक प्रशासन के बाद, प्लाज्मा में एकाग्रता छोटी आंत और बृहदान्त्र के नमूनों की तुलना में बहुत कम है, और मल में रिकवरी दर 24 घंटों के बाद 20% तक पहुंच जाती है। सुरक्षा मूल्यांकन से पता चला कि पेप्टाइड NO.1185 ने 10 μM पर G प्रोटीन युग्मित रिसेप्टर्स, ट्रांसपोर्टर्स और आयन चैनलों सहित 44 लक्ष्यों पर निरोधात्मक प्रभाव प्रदर्शित नहीं किया।

इसके बाद, प्रोटागोनिस्ट ने पीटीजी-200 या पेप्टाइड नंबर 1185 संरचनाओं के आधार पर कई व्युत्पन्न पेटेंट प्रकाशित किए, जिन्होंने विभिन्न अवशेष स्थलों पर संरचनात्मक व्युत्पत्तियों के माध्यम से गतिविधि और स्थिरता को और अनुकूलित किया। संबंधित संशोधनों का विवरण पेटेंट WO2018136646, WO2020014646, WO2021007433, और WO2021146458 में पाया जा सकता है। इसके अलावा, प्रोटागोनिस्ट ने 34 अमीनो एसिड युक्त चक्रीय पेप्टाइड IL-23R अवरोधक को कवर करने वाले एक पेटेंट (WO2018022937) के लिए भी आवेदन किया है, जिस पर इस लेख में आगे चर्चा नहीं की जाएगी।